مدرسه مفید قدمتی نزدیک به ۴٠ سال دارد؛ یعنی زمانی که موسسان موسسه خیریه مکتب امیرالمومنین(ع)، با محوریت حضرت ایت الله موسوی اردبیلی بر آن شدند تا با هدف اشاعه فرهنگ دینی، مدرسه ای را تاسیس کنند. این مدرسه سال۱۳۵۱ در حوالی میدان انقلاب، با مدرسه راهنمایی آغاز به کار کرد. پس از مدتی با تاسیس دبیرستان، به خیابان زنجان منتقل شد . بعد از گذشت بیش از دو دهه، دبیرستان و راهنمایی مفید دو نیز در سالهای ۷۱و ۷۶ در منطقه قیطریه تهران، در بلوار کاوه تاسیس شدند.